В 1828 году К. М. Бэр опубликовал первый том своего классического сочинения «История развития животных»; в 1837 году – второй; третий, незаконченный том вышел посмертно в конце XIX столетия.
В Кенигсберге К. М. Бэр получил признание всего ученого мира, здесь же он обзавелся семьей, но его тянет в родные края. Он ведет переписку с Дерптом и Вильно, где ему предлагают кафедры. Он мечтает о большом путешествии по северу России и в своем письме к первому русскому кругосветному мореплавателю знаменитому адмиралу Ивану Федоровичу Крузенштерну просит его дать ему «возможность бросить якорь в своем отечестве».